实验室已经建立了包括《实验室岗位聘任制实施办法》、《技术产品管理办法》、《技术合同管理办法》、《关于加强知识产权保护的暂行规定》、《科技奖励办法》等一整套适用的管理规章，保证了实验室的持续稳定发展。为了实现重点实验室的建设目标，设立了具有切实可执行的内部考核机制：（1）将团队考核与个人考核相结合，重点考核团队，据此制定各团队的年度刚性目标和届期（三年为一届）刚性目标；（2）采取多种激励机制鼓励团队成员在论文（专著）、项目、获奖以及发明专利等方面取得高水平成果；（3）以聘期考核结果和研究方向未来建设发展需要为依据，采用确定性或竞聘方法对各团队核心成员实行优胜劣汰及轮换制。同时，每年度采用竞聘方法引进核心团队外成员，在确保团队稳定的基础上，提高整体的竞争力和创新力；（4）对届期考核不合格的重点实验室专职人员，下一届不再以专职人员身份进入重点实验室；（5）对考核合格的核心团队，实验室将加大投资及建设力度，对连续两届考核不合格的核心团队，实验室将对团队进行降级资助，连续三届考核不合格的团队将自动退出重点实验室；（6）对所培育的支撑团队进行年度考核，考核通过后将加大支持力度，连续两年考核不通过将取消对该团队的支持。